在Linux下如何批量执行代码

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在Linux下批量执行代码的方法。复杂的可以用snakemake编写定义规则,简单的用shell直接写就可以。

示例代码

想要实现的目标:
1, 有0-9, 10个文件夹
2, 依次进入文件夹, 执行run.sh脚本, 因为运行时间长, 想用nohup run.sh &放到后台, 同时保存运行日志nohup.out

1for i in  [0-9]*; #1
2    do 
3    cd $i; #2
4    nohup run.sh &; #2
5    cd ../;
6done
 

报错
因为我中间用了&符号, 提前进入后台, 无法进入下一个循环。

如果不用&, 那么就是顺序执行,不能批量进行。

1for i in  [0-9]*; #1
2    do 
3    cd $i; #2
4    nohup run.sh; #2
5    cd ../;
6done
   

成功代码

1for i in  [0-9]*; #1
2    do 
3    cd $i; #2
4    echo "nohup run.sh &" | bash; #2
5    cd ../;
6done
 

这里, nohup一行命令, 先用echo打印, 完整的命令nohup run.sh &,然后用| bash执行前面的命令,这样的方式就可以实现我想达到的目的。

写成一行的代码

1for i in  [0-9]*; do  cd $i;   echo "nohup run.sh &" | bash;   cd ../;done

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网页题目:在Linux下如何批量执行代码
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